石景山区位于北京市西部, 辖区东西宽约 12.25 公里, 南北长约 13 公里, 总面积85.74平方公里。东抵玉泉路, 与海淀区相连; 南至张仪村, 与丰台区接壤; 西濒永定河, 与门头沟区相邻; 北倚克勤峪 (曾称荐福山) , 与海淀区搭界。
石景山区地形西北高东南低。北部为连绵起伏的山地、 属太行山北端余脉向平原的延伸部分, 有克勤峪、 天泰山、 翠微山、 青龙山、 虎头山等山峰40余座。山区约占全区总面积的三分之一。中部和南部为永定河冲积形成的微顷斜平原, 有海拔200米以下的石景山、 金顶山、 老山、 八宝山等残丘, 横亘其间。最高处为北部的克勤峪 ,海拔797.6米, 最低处为东部石槽东南的农田, 海拔仅58.1米。
石景山区地处永定河冲洪积扇顶部, 永定河为流经区境的唯一天然河流, 地下水资源比较丰富。石景山区矿泉水水源地占全市矿泉水水源地的5.88%, 另有甘泉12处, 其中八大处龙王堂龙泉为北京地区最佳泉水之一。
石景山区属暖温带半湿润半干旱大陆性季风气候, 四季分明。年平均降水量573.11毫米, 是华北地区降水量较多的地区之一。石景山区地质构造复杂, 新构造运动强烈。从山区到平原, 植被特征明显。福田寺、 衙门口、麻峪一带是土地肥沃的农业生产地区。
石景山地区地震、 干旱、 洪涝、 冰雹和虫害等自然灾害比较频繁, 其中以洪涝灾害最为突出。历史上, 永定河是海河水系中洪灾最多的一条河流, 从金代到新中国建立的近800年间, 永定河决口81次, 漫溢59次, 改道9次。新中国建立后, 在永定河上游修建官厅水库, 在三家店修建拦河坝等设施, 先后5次加固永定河左堤, 修建横贯本区中部的永定河引水渠, 源源不断地向市、 区工业、 农业和城市园林供水。由于进行系统的水利建设, 防汛得力, 洪涝灾害均未构成威胁。