《南昌工程学院报》的前身是《南昌水专报》，主编是时任党委书记的张乐天同志，试刊时的副主编是温振英同志，1995年1月正式创刊时的副主编是时任党委宣传部部长的陈年绍同志，常务编辑是胡俊华同志，刊号为赣内报字第01-041号。1997年9月，根据新闻出版署的统一调整，校报改为内部资料，更名为《南昌水专》。1999年6月，通过教育部与新闻出版署的协调，校报恢复并获国家统一刊号，刊号为：CN36—0814（G），同时更名为《南昌水专报》。2004年5月，随着学校升本，南昌水专发展成为南昌工程学院，校报亦更名为《南昌工程学院报》。2006年10月，校报由四开版改为对开版。