校旗是代表学校的标志性旗帜。上海交大有一面鲜艳、醒目的校旗，红黄两色正是国旗的标准色，“上海交通大学”六个大字使用了毛体题字，每到重大活动时，上海交大的校旗高高飘扬在师生中间（图4）。
　　在已有的史料中，可以搜集到交大百余年历史上的三款校旗，现略作介绍。
　　南洋公学时期，在 1909年曾制订了一款校旗（图1）。图中绣以一头雄狮和一个地球，雄狮英姿焕发，双眼目光炯炯，傲视前方，前脚掌踩踏地球，全身迸发着勃勃生机。在那样一个国家羸弱落后、国民贫穷无知的年代，南洋公学的这面校旗表达了南洋学人的一种理想与志向：要为国家与民族的繁荣富强而努力学习，要勇于向现代科学技术挑战；努力吧，年轻人，发展了实业的中华民族，一定会崛起振兴，称雄于世界。
　　此后，学校曾屡屡更新校旗。遗憾的是，我们在已有的档案查询中，一直未见这些校旗的图像。但在这些时期学校的校歌中均多次提到“校旗”，如1915年的《上海工业专门学校校歌》中有“光辉我国徽，便是光辉我校旗”之语；1920年代的《南洋大学校歌》中有“增进我南洋黄蓝校旗之光辉”之语，说明当时校旗以黄蓝两色而成；1928年的《交通大学校歌》中有“校旗飘扬，与日俱长”之语。这些都表现出当年的校旗使用之频繁，也反映了校旗在交大人心中的位置。
　　新中国成立以后，学校于1950年 7月 7日由校务委员会主任委员吴有训、副主任委员陈石英联合署名，以809号文发布公告“公布本校校旗式样”，文件称，“兹经本校校务委员会第 52次会议通过本校校旗式样”。该校旗以正红色为底色，横置长方形，正面左上方为一颗金黄色五角星，五角星右侧斜下方置交大校徽图样；在正面的右下方则缀正方体的“交大”二字。（图2）这面校旗标有“交大”字样，绘有交大校徽，颇具学校的特色；红色底面和黄色五角星表示在党和国家的领导下，交大一定能够弦诵不绝、学门昌达。
　　1950年12月23日，学校接华东军政委员会教育部《为通知关于中央指示各级校馆旗帜式样的规定》（第008724号）。文件对各级校馆旗帜式样作出规定：“各级校馆旗帜不必强求统一，其式样应采用特种形式，或用特种颜色，或用特种标志，只要容易识别即可，不必作硬性统一规定。各级校馆旗帜的幅度，可参照国旗尺寸制定，但不得大于国旗，更不必按校馆等级加以区分，又校馆旗帜图案，注意不要与国旗、军旗混通”。对照这一文件精神，当年学校所设计的校旗还是符合要求的。
　　但是时隔不久，1952年 9月29日，又接教育部发出《关于各级学校校旗、证章式样的原则规定》，文中指出，“各级学校不必制定校徽；校旗只需用简单颜色，表明校名即可，不必另加图样”。据此文件精神，前面所设计的交大旗帜则不能用了；而代之以使用的就是沿用至今的红色底面加校名的校旗，其文字原为“交通大学”，1959年后为“上海交通大学”。自此，国内各大学的校旗亦为千篇一律；数十年来，这一状况已被大众所接受，至今仍无大改变。
　　2004年，学校公布的《上海交通大学视觉形象识别标准手册（试行）》中对于校旗的基本格式加以标准化，校旗的图式亦未有根本变化。（图3）最近，学校向校内外广泛征集“上海交通大学”校旗式样图案，这是一件大好事，是我校文化建设的一个新举措。从上述的介绍中可以了解到，高等学校的校旗应具有学校的个性，目前千校一面的校旗是特定历史时期的产物，当前我们要以“三个代表”思想和科学发展观为指导，重新审视和设计我们的校旗。交大的校旗必须有交大的个性，清晰简明、一目了然，给人以深刻的印象。新校旗从图形、文字、颜色、面料质地等方面都应较之原有校旗有所突破，既有百年交大的历史特征，又能够体现出新时期交大人的精神面貌。
　　我热切地期盼着上海交大的新校旗早日面世。